Az 1.16.2-es verziótól a program parancssori módban is elindítható. Egy egyszerű paranccsal különálló fájlokat vagy mappákat dolgozhat fel, és felépítheti saját képfeldolgozási munkafolyamatát!
Az AutoSplitter többféleképpen használható: automatikus felismeréssel, kézi kivágásokkal, a kivágási területek újbóli felhasználásával vagy előre beszkennelt képek kötegelt feldolgozásával.