Od verze 1.16.2 můžete program spustit v režimu příkazového řádku. Jednoduchým příkazem zpracujete jednotlivé soubory nebo celé složky a vytvoříte si vlastní postup zpracování obrázků!
Fotografie lze v AutoSplitteru skenovat několika způsoby: automatickým rozpoznáním, ručním vymezením ořezů, opakovaným použitím oblastí ořezu nebo hromadným zpracováním již naskenovaných fotografií.